生殖器上长痣一般是遗传、不良生活习惯、表皮细胞过度发育、雌性激素水平的改变、色素沉着等原因导致。
1、遗传：痣有一定的遗传特征，如果父母身上的色素痣比较多，孩子可能会遗传，长痣的部位并不固定，除了生殖器外，其他部位也会长。这是正常现象，一般不需要处理，但要观察痣的大小和形状变化。
2、不良生活习惯：如果经常熬夜，或精神压力比较大，容易造成体内的色素分泌异常，部分黑色素会在生殖器局部聚集，形成黑痣。需及时改变不良的生活习惯，每天保证充足睡眠，并适当放松情绪，促进色素消退。
3、表皮细胞发育过度：若生殖器表皮细胞发育过度，容易引起局限性发育异常，出现淡黄色或棕色隆起，一般不会伴随明显不适，可通过激光、冷冻等物理方法消除。
4. 雌性激素水平的改变：雌性激素水平的波动可能导致痣的增多，尤其是在青春期、孕期或更年期等生理阶段。
5、色素沉着：生殖器皮肤本身就容易出现色素沉着，即使是正常情况下，痣的出现也可能与色素沉着有关。
痣一般对身体没有伤害的，但如果痣出现疼痛、瘙痒、出血、增大或颜色变化等异常情况，应及时就医进行检查，以排除恶性病变的可能。